「我的」基因?奇妙的鑲嵌現象(mosaicism)

分享至

■Priest醫師無法理解自己所看到的一切。他正在為一位重症嬰兒檢查DNA,試著找出威脅她心跳的基因突變。然而,根據檢查結果,這些基因彷彿是從另一個完全不同的嬰兒身上所取得的。

(Photo credit: Rebekah D. Wallace, University of Georgia, Bugwood.org)

撰文|莊宇真

根據過去我們在生物課所學,打從我們還是受精卵開始,細胞依規律進行分裂,忠實地將染色體複製到子代的細胞裡,最終組成我們的身體。因此,我們會認為,「基因組」(Genome)是一項專屬於自己的穩定特徵,像是指紋一般。

然而,最近數十年來,有越來越多研究發現,基因組並不只是在人與人之間有差異,它也可能在同一個身體裡、細胞與細胞之間產生。簡單來說,在我們的身體裡,可能在心臟細胞與肺臟細胞之間,分析出不同的基因訊息。

這種在同一個生物體身上,同時擁有兩種或更多具有不同基因型細胞的現像,被稱為「鑲嵌現象」(mosaicism)。在人類,當鑲嵌現象發生在本身具有染色體數目異常或其他遺傳疾病時,可能會使症狀較輕微,因為鑲嵌現象意味著身體裡有一部分的細胞是帶有未突變基因的。例如:性染色體缺少一個X的女性透納氏症(Turner's syndrome),若是在鑲嵌染色體的病人身上,病人可能症狀不明顯、或仍擁有正常的女性生理週期(因為身體裡有的細胞是XO、有的是XX)。

●鑲嵌現象在植物界~無心插柳

在中世紀的歐洲,旅人長途跋涉,穿越森林的途中,有時會遇見一種令人毛骨悚然的樹。樹幹上冒出了另一種不同的植物,密集地形成一綑枝條,像是人們所製造的掃帚。德國人將它稱為「女巫掃帚」(Hexenbesen)。

19世紀,植物育種人發現,當他們將「女巫掃帚」砍下、嫁接到另一棵樹上時,這個「掃帚」將會既續生長且結種子,而這些種子也會長出女巫掃帚。

今天,你可以在尋常市郊的草坪上看到女巫掃帚的例子。矮種白雲杉(dwarf Alberta spruce)是來自加拿大的景觀植物(像是小顆的聖誕樹),最高可長到300公分左右。1903年,植物學家第一次發現它時,它正緊緊依附在一棵白雲杉上;白雲杉本身是可長到將近10層樓高的巨大杉木。

粉紅葡萄柚(pink grapefruit)也是在類似狀況下被發現的。一個佛羅里達州農夫注意到,Walters葡萄柚樹上長出奇怪的分枝;Walters葡萄柚通常產出的是白柚,然而這個分枝卻長出有粉紅果肉的葡萄柚。從那以後,這些種子就被拿來直接種植出粉紅葡萄柚樹。

將近160年前,以《物種起源》一書撼動演化理論的達爾文(Charles Darwin, 1809-1882)深深受到這類奇特景像的吸引。他對於在開花植物所發生的「芽變」(bud sport; bud mutation; bud variation)現象,也就是在同一種植物中,產生非典型、奇特的花,感到十分好奇。達爾文猜想這或許是能解開遺傳秘密的線索。

經過累積無數的研究後終於瞭解,「女巫掃帚」與「芽變」都是鑲嵌體的例子。大自然用細胞創造了它,將不同的基因樣貌融合在這片視覺饗宴裡。

●鑲嵌現象無所不在

美國哈佛大學的基因學家Christopher Walsh與其研究團隊在一個意想不到的地方發現了鑲嵌現象的證據。

罹患「半邊巨腦症」(hemimegalencephaly)的病人會有半邊大腦過度生長的情形,通常伴隨難以控制的癲癇針對無法以藥物控制的病人,可能會透過大腦半球切除術(hemispherectomy)來進行治療。研究團隊於是使用手術切除的組織進行檢驗。在病人的腦部細胞裡,研究者發現有一部分細胞具有相同突變基因。可能的推測是,這些突變的神經細胞分裂速度比正常腦部細胞更快,因此促成單側大腦巨大的情形。

Dr. Walsh和研究團隊後續進一步在健康人大腦中發現了複雜的鑲嵌現像。研究人員從一名意外死於車禍的17歲男孩腦中,取出神經細胞進行DNA定序,並與男孩肝臟、心臟、與肺臟細胞裡的DNA進行比較。研究發現,每個神經元都有上百個身體其他器官細胞沒有的突變。然而,許多突變僅在部分神經細胞之間是相同的。

Dr. Walsh因此有了靈感,他嘗試藉由這些突變來重建細胞世系(cell lineages) – 也就是瞭解它們是從何發源的。研究人員將每個神經細胞依其親疏遠近連結起來,根據完成的繪製結果,可歸納出5個主要世系。每個世系裡的細胞皆遺傳有相同的、獨特的鑲嵌記號。

更奇怪的是,科學家在男孩的心臟細胞發現了與大腦神經細胞相同的突變記號。其他世系也分別有與其他器官相同的情形。根據此結果,研究人員為男孩的大腦拼出它的一生。當男孩還是子宮裡的胚胎時,5個細胞世系誕生了,每個世系也分別帶有其獨特的突變。接下來,不同世系的細胞往不同的方向遷移,最後發展成不同的器官 – 包括大腦。

美國奧勒岡健康與科學大學(Oregon Health & Science University)的生物學家Markus Grompe與他的同事,對於沒有肝臟疾病的兒童及成人,觀察他們的肝臟細胞。其中約有1/4至一半的細胞染色體是非整倍體(aneuploids),多數是缺失了一套染色體。

2017年,英國維康桑格研究所(Wellcome Trust Sanger Institute)的研究者檢驗了241名女性的白血球DNA序列。每位女性皆有約160個新的突變,每個突變皆在其細胞中佔有一定的比例。

早期研究推測,鑲嵌現象很可能是許多疾病的肇因。2017年,Dr. Walsh與其研究團隊發表於Nature Neuroscience,針對「泛自閉症障礙」(autism spectrum disorder, ASD)的病因,試圖從鑲嵌突變找出線索。

不過,科學家同時也發現到,鑲嵌現象不必然等於有疾病。事實上,通常是沒有疾病的。當一個受精卵(合子)開始於子宮內分裂,許多早期分裂出來的子代細胞,是具有錯誤染色體數量的細胞。多數這些細胞會因此分裂緩慢且死亡;不過,在帶有不同染色體狀況的前提下,還是有相當高比例的胚胎是可以存活的。

●消失的突變~心臟科的小小病人

Astrea Li,在她剛出生那天就發生心跳停止。她的主治醫師決定進行植入去顫器(defibrillator)的手術,使Astrea的心律能回復正常。

美國史丹佛大學的小兒心臟科James Priest醫師對Astrea的基因組進行定序,試圖找出造成此疾病的原因。他在其中一套基因找到了SCN5A突變,而這個基因所轉譯的蛋白,原本是負責協助心跳的起動。但當Dr. Priest試圖用另一種檢測方法時,這個突變就這樣消失了。

Dr. Priest不敢相信,為追根究底,他找了學校裡專長於細胞基因組定序的生物學家Steven Quake一塊來幫忙。他們從寶寶血液中抽出36個白血球,然後對每一個細胞進行完整基因組的定序。在其中33個細胞,兩套基因裡的SCN5A都是正常的。然而,在剩下的3個細胞裡,研究人員在其中一套基因找到了突變。原來,鑲嵌細胞存在Astrea的血液裡。

數月後,Astrea再次回到醫院接受心臟移植手術,後續復原良好,返家享受她應有的快樂童年生活。這個移植手術不只讓Astrea獲得了新生,同時也讓Dr. Priest有機會瞭解心臟的鑲嵌基因。Dr. Priest與同事則分別從Astrea心臟不同部位的肌肉細胞萃取出SCN5A基因,分析後發現:在心臟右側,超過5%的細胞有突變;左側則有將近12%的細胞有此突變。

●鑲嵌著未知的未來

在小小病人Astrea提供了如此珍貴的研究經驗之後,Dr. Priest不禁思索,有多少人正因為這種鑲嵌潛藏的突變而處於風險之中?然而,在下個Astrea走入科學殿堂之前,這個答案很可能始終是未知的。

面對我們身體裡可能存在著的「鑲嵌現象」,目前仍很難去論斷,這對我們的生命將有何影響。但我們可以確知的是,鑲嵌現象為生物體的發展帶來了「不可預測性」(randomness)。正如同突變,原本就是來自隨機的現象,在每個人身上都會帶來不同的呈現。

「縱使是來自同一個合子(zygote),也永遠不可能發展成同一樣子第二次。」Dr. Walsh如是說。

 

報導出處:Carl Zimmer (May 21, 2018). Every Cell in Your Body Has the Same DNA. Except It Doesn’t. The New York Times.

參考文獻:

  1. “Mosaicism” (Nature.com). https://www.nature.com/subjects/mosaicism
  2. 賴英明(1.8)。染色體鑲嵌現象 ( Mosaicism )。取自:http://www.pansivf.com.tw/know/detail/50
  3. Graca JVD, Louzada E, Sauls JW. 2004. The Origins of Red Pigmented Grapefruits and the Development of New Varieties. Conference: Proceedings, International Society of Citriculture, At Agadir, Morocco, Volume: 1 Pages 369-374.
  4. 陳虹潔、郭萬祐(2009)。半邊巨腦症(Hemimegalencephaly)。臨床醫學 63: 317-20。
  5. Poduri A, Evrony GD, Cai X, Walsh CA. 2013. Somatic Mutation, Genomic Variation, and Neurological Disease. Science 341(6141), 1237758.
  6. Lodato MA, Woodworth MB, Lee S, Evrony GD, Mehta BK, Karger A,…Walsh CA. 2015. Somatic mutation in single human neurons tracks developmental and transcriptional history. Science 350(6256), 94-8.
  7. Duncan AW, Hanlon Newell AE, Smith L, Wilson EM, Olson SB, Thayer MJ, Strom SC, Grompe M. 2012. Frequent Aneuploidy Among Normal Human Hepatocytes. Gastroenterology 142(1), 25-28.
  8. Ju YS, Martincorena I,…Stratton MR. 2017. Somatic mutations reveal asymmetric cellular dynamics in the early human embryo. Nature 543, 714-8.
  9. McConnell MJ,…& Brain Somatic Mosaicism Network. 2017. Intersection of diverse neuronal genomes and neuropsychiatric disease: The Brain Somatic Mosaicism Network. Science 356(6336), eaal1641.
  10. Lim ET, Uddin M,…Walsh CA. 2017. Rates, distribution and implications of postzygotic mosaic mutations in autism spectrum disorder. Nature Neuroscience 20, 1217-24.

 

--
作者:莊宇真,畢業於交通大學科技法律研究所,現任生物醫學倫理領域專任研究助理。人生最樂之事莫過於找到自己的志業,寫作之於我正是如此。為城邦部落格《健康知心》之格主,擔任國內《熟年誌》雜誌醫藥新知特約作者。知識是觸角,讓人掌握世界;健康是財富,讓人享受人生。

 

加入好友

(Visited 1,639 times, 1 visits today)

分享至
views