- 2014諾貝爾化學獎的遺珠:結構光照明顯微法 2015/01/22
2014諾貝爾化學獎的遺珠:結構光照明顯微法
東京大學化學所專案助理教授邱亮達 撰文/東京大學理學博士陳藹然 責任編輯2014年諾貝爾化學獎頒給了「超高解析螢光顯微法」的開發者,得獎的顯微法包括 「受激放射消去顯微法」 (STED microscopy) 以及「光啟動定位顯微法」 (PALM)。然而,從事生物影像相關研究者應該大致上都同意在此二技術之外應還有一種超高解析顯微法 ─「結構光照明顯微法」 (SIM, structured-illumination microscopy) 也有資格同獲這頂諾貝爾桂冠。本文即將介紹此一技術的原理機制,以及為何此一技術最終與此頂諾貝爾桂冠無緣。 Continue reading →
- 謎樣的分子:克里奇中間體 2015/01/09
謎樣的分子:克里奇中間體 (Criegee intermediates, CIs)
國立臺灣大學科學教育發展中心陳藹然博士2012年初,一篇備受矚目的突破性研究論文在期刊「科學 (Science)」上發表,標題是「從 $$CH_2I$$ 和 $$O_2$$ 的反應直接進行克里奇中間體的動力學測量」。ScienceDaily 撰文報導:科學家發現一個對抗全球暖化的新利器─大氣中能冷卻地球的分子;BBC新聞科學版也發文介紹這個「謎樣」的分子。這種特殊分子叫做「克里奇中間體 (Criegee intermediates, CIs)」或「克里奇雙自由基 (Criegee biradicals)」,得名自德國有機化學家克里奇 (Rudolf Criegee)。 Continue reading →
- [新聞] 臺灣年輕團隊成功捕捉「克里奇中間體」與水分子的關鍵化學反應 2015/01/06
臺灣年輕團隊突破研究氣壓上限 成功捕捉大氣活潑分子與水蒸氣之化學反應
中央研究院2015年1月6日新聞稿大氣中一種名為「克里奇中間體」 (Criegee Intermediates,簡稱CIs,化學式R2COO,R為氫原子或烷基) 的活潑分子是大氣化學中的關鍵角色,更與大氣中的酸雨、懸浮微粒現象息息相關。然而由於CIs壽命十分短暫,很難捕捉或偵測,學界對此快閃神秘分子向來瞭解甚少。 Continue reading →
- 費雪投影式的定義與應用 2014/11/19
費雪投影式的定義與應用 (The Definition and Application of Fischer projection)
國立臺灣師範大學化學系陳筱鳳研究生有機化學中,常常以平面圖示簡化表示分子的立體化學結構,不僅容易理解也較好記憶,對於在判定結構組態時也有幫助。其中一種二維表示方式,費雪投影式 (Fischer projection),由德國化學家赫爾曼·埃米爾·費雪 (Hermann Emil Fischer)於1891年所提出,是一種以不改變其性質亦或是結構之表示法。[1] 一開始主要用來簡化表示非環形之碳水化合物結構,亦可直接判斷出分子的絕對組態 (absolute configuration),廣泛使用於醣類化學。 Continue reading →
- 海龍滅火 2014/11/19
海龍滅火 (Fighting fires with halons)
國立臺灣師範大學化學系學士班三年級黃仲楷海龍滅火原理:
當一有機化合物承受到了過多的能量時,它的單鍵會發生均勻裂解(homolytic bond cleavage)生成自由基,接著與氧分子發生反應。
這一系列的自由基鏈鎖反應會一直持續到大部分的 \(\mathrm{C}\text{-}\mathrm{C}\) 和 \(\mathrm{C}\text{-}\mathrm{H}\) 鍵都被打破然後重生為 \(\mathrm{CO_2}\) 和 \(\mathrm{H_2O}\)。為了使這鏈鎖反應能持續存在,需要三個基本要素:燃料、氧氣和熱量。因此為了使他的反應能夠中止,至少要剝奪這3個條件的其中一項,才可以達成目的。很多試劑都可以被用來滅火。常見的有 \(\mathrm{CO_2}\)、\(\mathrm{H_2O}\)、氬氣,其中 \(\mathrm{CO_2}\)、氬氣是剝奪了「氧氣」這個條件,水則是剝奪了熱量。 Continue reading →
- 偕二醇 2014/11/19
偕二醇
國立臺灣師範大學化學系學士班一年級范智傑偕二醇是同一個碳上接有兩個羥基 (hydroxyl) 的有機化合物。一般來說是羰基水合的產物,它和羰基之間存在平衡關係(如圖一)。
影響偕二醇比例的原因:
羰基旁的取代基 (substituent) 會影響到羰基上碳的電子密度。在沒有取代基的情況下,也就是甲醛 (methanal),偕二醇的比例是非常高的,事實上在甲醛的水溶液中是幾乎沒有甲醛單體的,拉曼光譜 (raman spectroscopy) 也無法觀察到羰基的蹤跡。
1950 年代,Iliceto、Trumpler、Bieber 等人利用其他分析方法得到甲醛水合的平衡常數 \(0^\circ C\) 時 \(=10000\),\(30^\circ C\) 時 \(=57000\),\(64^\circ C\) 時 \(=301000\)。
乙醛的部分因為有烷基推電子的關係,羰基的碳上電子密度 (electron density) 上升,等於幫助羰基穩定自己的正電荷,比較不需要吸引氧的孤對電子 (lone-pair electrons) 形成偕二醇以取得更多電子密度,乙醛水溶液中偕二醇的比例已經小於百分之一。丙酮 (acetone) 有兩個烷基推電子,羰基上的碳電子密度更高,偕二醇的比例就更低了(如圖二)。
相反的,當取代基為三氯甲基 (trichloromethyl-),也就是三氯乙醛 (trichloroethanal) 時,因為三氯甲基具有拉電子的效果,使羰基電子密度下降,比沒有取代基的甲醛更容易水合。甲醛形成的甲二醇 (methanediol)是無法分離的,也就是說甲醛一旦蒸發就是以單體的形式存在。
三氯乙醛的水合物比甲醛水合物更穩定,是可以分離的。其他的吸電子取代基如三氟甲基 (trifluoromethyl-) 等也有類似的效果,由兩個三氟甲基當取代基的六氟丙酮 (hexafluoroacetone),水合的平衡常數已經達到一百萬,無水物在空氣中會快速潮解(如圖四)。
偕二醇和醛氧化的關係:醛類羰基上的碳本身是缺電子的,利用氧的孤對電子氧化也不容易。醇被氧化的過程中如果到醛的時候無法被溶劑化形成二醇或其他有羥基的結構,便不再繼續氧化成酸,停留在醛(如圖五)。
同樣使用六價鉻當氧化劑,在二甲基甲醯胺 (N,N-dimethylmethanamide) 和二氯甲烷 (dichloromethane) 中反應的結果不同,因為二甲基甲醯胺能像水一樣與醛化合,形成類似二醇的結構,進一步氧化成酸;二氯甲烷沒有這樣的能力,醇氧化到醛的時候就停止了,不再繼續氧化。
醛在水溶液中的還原力和偕二醇的比例是有關連性的,在與斐林試劑 (fehling’s solution) 反應的過程中,反應速率是甲醛>乙醛。大部分的情況下醛與斐林試劑反應時,斐林試劑中的二價銅離子會被還原成一價的氧化亞銅,甲醛的還原力比其他的醛強,有能力將二價銅離子還原成零價的金屬銅。
茚三酮 (2,2-dihydroxyindane-1,3-dione),一種常用於檢驗氨、一級胺、二級胺、胺基酸的化合物,以水合的形式存在。大部分的醛酮都是形成水合物後較不穩定,茚三酮發生反應的那個羰基因為周圍有兩個羰基吸電子,降低其電子密度,較容易水合形成偕二醇,穩定度反而比酮的形式還高(如圖六)。
羰基碳上缺電子是這個基團發生反應的重要原因,越缺電子就越容易和親核基 (nucleophile) 反應,水只是眾多親核基的其中一種,也是反映這個化合物中羰基活性的指標之一。
參考資料
- 胡躍飛主編,現代有機合成試劑(1)氧化反應試劑,化學工業出版社P10~11
- J.Frederic Walker,Formaidehyde,Third Edition,P79~84
- http://en.wikipedia.org/wiki/Geminal_diol
- http://chemwiki.ucdavis.edu/?title=Organic_Chemistry/Aldehydes_and_Ketones/Reactions_of_Aldehydes_%26_Ketones/Addition_of_Water_to_form_Hydrates_(Gem-Diols)
- http://en.wikipedia.org/wiki/Ninhydrin
- 重烯 2014/11/17
重烯 (allene)
國立臺灣師範大學化學系碩士班二年級翁于婷研究生重烯(allene)是一種特別的化學結構。其中心的碳具有兩個碳-碳雙鍵,形成三個碳都互相以雙鍵相連的化合物。丙二烯(propardiene)就是最簡單的重烯化合物。如果結構中也含有重烯結構,但是碳數多於三個的化合物我們稱之為疊烯類(cumulenes)。因為此結構具有的特殊性質,所以其反應性及活性也比其他單純的烯類還要高。 Continue reading →
- 鮑德溫規則 2014/11/16
鮑德溫規則 (Baldwin’s rules)
國立臺灣師範大學化學系碩士班二年級胡婷嘉研究生許多化合物中都含有環形結構,預測起始物會經過甚麼樣的反應機構,而形成環化產物就是很重要的步驟。而最廣為人知的推測方式就是鮑德溫規則 (Baldwin’s rules)。也稱為鮑德溫閉環規則。鮑德溫規則最早是在 1976 年,整理了很多實驗的數據所歸納而來的。鮑德溫規則的基礎就建立在觀察和各原子在立體空間中的關係,例如:鍵與鍵中間的距離、鍵角和其他原子離反應中心的位向。 Continue reading →
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