基因掃描與DNA檢測(Genetic Screening and DNA Test)
基因掃描與DNA檢測(Genetic Screening and DNA Test)
臺北市立松山高級中學生物科莊雪芳老師/國立台灣大學動物學研究所陳俊宏教授責任編輯
一種生物的基因體(genome)是指該生物染色體上所有的遺傳物質,其大小常採用鹼基對的數目來表示。蛋白質體(proteome)則是指一個基因體的全部蛋白質產物及其表現情況。許多基因經過轉錄和轉譯作用後,產生的蛋白質不只一種,其原因主要有兩點:一是單一基因在轉錄成mRNA時發生選擇性剪接,導致有不同的外顯子組合,因而產生不同的蛋白質。另一是轉譯後的蛋白質經修飾,使得蛋白質有更多不同的結構和功能,故蛋白質體比基因體要複雜多了。此外,人類基因體的 30 億個鹼基中,大約每個 100 到 300 個鹼基就可能出現一處單一核苷酸(A、T、C、G)發生變異,因而使得 DNA 序列也隨之改變,稱為單核苷酸多型性(single nucleotide polymorphism,SNP)。因此,個體間 DNA 的構造雖然非常相似,但微觀下其差異卻非常大,導致了個體間顯著的差異。人類基因體解碼後,發現不同個體間的序列極為相似,其中僅有 0.1% 的差異,此些微的差異決定了每個人的身高、膚色、體型等各方面的差異,也決定了我們的體質是否容易罹患某些疾病等不同特點。
當我們利用不同的限制酶(restriction enzyme)處理 DNA 時,由於每個人的 DNA 序列具有獨特性,所以 DNA 被切割成的片段長度不盡相同,經過電泳分析的結果也不同。此種利用限制酶處理,得到不同 DNA 片段長度的多型性,稱為限制酶片段長度多型性(Restriction fragment length polymorphisms,RFLPs)。由於每個人的 RFLPs 都不同,就像我們的指紋一樣,因此 RFLPs 又被稱為 DNA 指紋(DNA fingerprinting)。RFLPs 技術已被廣泛應用在刑事案件和遺傳疾病的鑑定上。
RFLPs 技術也可應用於基因掃描(genetic screening),檢驗胚胎、胎兒或新生兒是否患有基因異常的疾病,以便快速施用藥物治療。若親戚患有基因疾病,自身卻無症狀的人,也可藉由基因掃描來確定是否帶有突變基因或可能發展出此疾病。此外,DNA 檢測(DNA Test)是檢測基因的最精確方式,可直接分析 DNA 的突變情形。由於PCR(polymerase chain reaction)技術的成熟,DNA 檢測只需幾個細胞即可完成,適用於一個或少數個突變所造成的疾病。基因掃描與 DNA 檢測技術最常被應用於鐮刀型貧血症(sickle-cell disease)的檢驗。
鐮刀型紅血球疾病是指由鐮刀型血紅蛋白─S血紅素(hemoglobin S,HbS)所導致的一系列遺傳性疾病的總稱。鐮刀型貧血症只是其中一種,起因於β-Hemoglobin基因發生點突變,造成血紅素β在轉譯過程中第6個胺基酸由正常的穀氨酸(glutamic acid)換成纈氨酸(valine)。由於穀氨酸帶負電,而纈氨酸是電中性,使得血紅蛋白結構改變,導致紅血球內生成細長針狀物,因而造成紅血球變形,嚴重者通常會早夭,較輕微者則可生長發育。
鐮刀型貧血症的檢驗方式有兩種:一是 DNA 序列藉由 PCR 放大,經 MstII 限制酶進行切割,再跑電泳(gel electrophoresis)。正常序列被限制酶切割後,其分子量較小,跑得較遠;而不正常序列無法被限制酶切割,其分子量較大,跑得較近,因而可檢驗出是否帶有突變的基因。另一是利用人工合成兩種DNA 試紙(一為正常序列 GGACTCCTC,另一為不正常序列 GGACACCTC),來與經 PCR 放大的正常或突變 DNA 序列結合,再以顏色的變化來辨識是否帶有突變的基因。
參考資料:
1. Campbell, N. A. & Reece, J. B. (2005). Biology, 7th Ed. The Benjamin Cummings Publishing Company.
2. Sadava, D., Hillis, D. M., Heller, H. C. & Berenbaum, M. R. (2009). Life: The Science of Biology. 9th Ed. W. H. Freeman and Company.
3. Starr, C. & Taggart, R. (2006). Biology: The Unity and Diversity of Life. 11th Ed. Brooks Cole Publishing Company.


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