種系發生（Phylogenesis）

種系發生（Phylogenesis）
國立臺灣師範大學生命科學系何懿洲博士生

由於演化是十分漫長的過程，這也是研究種系發生的最大困難處，以現代科技來說種系發生無法直接通過觀察和實驗來驗證，現階段都以間接證據佐證為主。因此種系發生的研究並非是採用單一研究法而是綜合各領域研究證據而形成。目前研究種系發生是利用形態學和分子生物學兩種模式。

（一）形態學：藉由部份的化石形態學和解剖學特徵與現存生物的形態解剖學之比較，以及現生生物之間在生理學特徵之比較。形態學所採用的特徵被分為同源特徵和同功特徵兩種:（1）同源特徵：例如同源器官或是同源的行為方式，會顯示出相同的軀體基本構造，但是在不同環境的影響下會產生不同的外形或功能；（2）同功特徵：例如同功器官外形相似，功能相同，但它們並不是同一個構造而來，而是通過趨同演化獨立發展出來的；
（二）分子生物學：藉由 DNA 分析，例如定序，在研究方面如人類與黑猩猩根據 TCGSAC（2005）的報告指出兩個物種可能共有的 DNA 序列高達 $$98$$～$$99\%$$。通過化石的證據以及分子生物學的證據，人們就可以為生物建立一棵種系發生樹（演化樹），並在其中標示了各個物種之間可能的親緣關係。

但由於對這些證據的側重不同，經常造成多個不同的演化樹版本，例如原口類動物的幾個門究竟是歸到節肢動物（來自分子生物學方面的證據）還是環節動物（形態學方面的證據）。兩棲類先分支為「哺乳類」及「鳥類、近代爬蟲類」，「蛇與蜥」的分支較早於「龜與鱷」的分支（形態學方面的證據，圖一）。而近代爬蟲類中，龜可能是屬於較晚的分支。「鳥類、龜與鱷」的分支則較晚於「哺乳類」（來自分子生物學方面的證據，圖二）。

圖一、形態學方面的演化樹（何懿洲繪圖）

圖二、分子生物學方面的演化樹（何懿洲繪圖）

參考文獻：

• Carl Zimmer。2005。《演化-一個觀念的勝利》。唐嘉慧，譯。時報文化。