核糖核酸
核糖核酸 (RNA)
國立新莊高級中學陳偉民退休教師/國立臺灣師範大學化學系葉名倉教授責任編輯
核糖核酸 (RNA) 是生物學上重要的分子類型,由一長串的核苷酸為組成單位。每一個核苷酸都含有鹼基、核糖和磷酸根。RNA與DNA非常類似,但二者在結構的細節上有少許差異:在細胞中,RNA通常是單股,而DNA通常是雙股;RNA的核苷酸含有核糖,而DNA含有去氧核糖(缺少一個氧原子的核糖);而且,RNA含有尿嘧啶 (uracil),而DNA則含有胸嘧啶 (thymine)。RNA聚合酶將DNA轉錄為RNA,通常再由其他酶進一步催化。在合成蛋白質的過程中,RNA十分重要。名為傳訊者RNA的某種RNA攜帶來自DNA的資訊至核糖體,這些核糖體由蛋白質與核糖體RNA化合而成,形成可閱讀傳訊者RNA的分子機器,並把傳訊者RNA攜帶的訊息轉譯為蛋白質。還有很多種RNA,各有不同的任務,例如調控基因表現,而且RNA也可作為大多數病毒的基因體。
與DNA之比較
RNA與DNA都是核酸,但二者主要有三點不同。第一點,DNA為雙股,而RNA在大多數的生物功能上,都是單股分子,其核苷酸的鏈也比DNA短得多。第二點,DNA含有去氧核糖,RNA含有核糖(在DNA中,五碳糖環狀的2’位置沒有羥基)。因為這些羥基使得RNA容易水解,造成RNA比DNA不穩定。第三點,在DNA中,與腺嘌呤互補的是胸嘧啶,而在RNA中,則為尿嘧啶,尿嘧啶是胸嘧啶脫去甲基後的產物。
結構
在RNA中的每一個核苷酸都含有核糖,其碳原子編號為1’至5’。鹼基連接在1’位置,通常為腺嘌呤(A)、胞嘧啶(C)、鳥嘌呤(G)或尿嘧啶(U)。腺嘌呤和鳥嘌呤屬於嘌呤,胞嘧啶和尿嘧啶屬於嘧啶。磷酸根連接在核糖的3’位置和下一個核糖的5’位置。在生理條件下的酸鹼值,每個磷酸根都帶有負電荷,因此RNA為帶電分子(多電荷陰離子),如圖1。胞嘧啶與鳥嘌呤,腺嘌呤與尿嘧啶之間會形成氫鍵。然而,也有可能發生其他交互作用,例如一團腺嘌呤互相黏結而形成凸塊,或如GNRA四鹼環 (tetraloop) 中有鳥嘌呤-腺嘌呤鹼基對。
四鹼環是RNA二級結構中,一種由四個鹼基組成的環狀基本結構,位於許多雙螺旋的頂部。在核糖體RNA中有三種常見的四鹼環:GNRA、UNCG和CUUG。GNRA四鹼環含有鳥嘌呤-腺嘌呤鹼基對,其中鳥嘌呤以5’位置連接螺旋,而腺嘌呤以3’位置連接螺旋。
合成
RNA的合成反應通常受RNA聚合酶催化,以DNA為模板,此反應又稱為轉錄,轉錄由酶與DNA順序上的引導子 (promotor) 結合開始(通常可在基因的「上游」找到)。在解旋酶 (helicase) 作用下,DNA的雙螺旋可解開。接著,酶進一步沿著模板3’至5’的方向,合成互補的RNA分子,其生長方向為5’至3’。DNA順序也會指示RNA的合成應在何處終止。
RNA的種類
傳訊者RNA (mRNA) 負責攜帶DNA的訊息至核糖體,核糖體為細胞中合成蛋白質(轉譯)之處。mRNA的密碼順序決定其所產生之蛋白質的胺基酸順序,然而許多RNA並非蛋白質編碼(在真核生物 (eukaryote) 中,約有97%轉錄的結果為非蛋白質編碼)。
這些所謂的非編碼RNA (ncRNA),可被本身的基因編碼(RNA基因),但也可由mRNA內含子 (intron) 衍生而來。非編碼RNA中最有名的例子是轉送RNA (tRNA) 和核糖體RNA (rRNA),二者皆參與轉譯反應。也有非編碼RNA參與基因調控、RNA加工 (RNA processing) 與其他反應。某些特定的RNA可催化化學反應,如切斷及固定其他RNA分子,以及催化核糖體中肽鍵的形成,這些RNA稱為核糖核酸酵素 (ribozyme)。
參考資料
1. http://en.wikipedia.org/wiki/RNA
2. http://en.wikipedia.org/wiki/Tetraloop



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