zinc finger

鋅手指(Zinc finger)

鋅手指(Zinc finger)
國立臺灣師範大學生命科學系研究助理陶韻婷

鋅手指(zinc finger)是一種像手指形狀的蛋白質構形(motif),具有這種結構形狀的蛋白質能與DNA、RNA分子、蛋白質甚至脂類結合。Zinc finger蛋白質在真核生物細胞較常見,少見於原核細胞,是主要調控基因轉錄的蛋白質,在許多基礎的細胞生化反應都扮演重要的角色,如:複製(replication)、修復(repair)、轉錄(transcription)、轉譯(translation)、代謝(metabolism)、訊號傳導(signaling)、細胞增殖(cell proliferation)以及細胞凋亡(apoptosis)等。

蛋白質的結構可分為四級。一級結構(primary structure)為胺基酸的排列,而二級結構(secondary structure),如α螺旋(alpha-helix)及β摺板(beta-sheet),則是由不同胺基酸彼此之間的分子作用力(如氫鍵(hydrogen bond)、凡德瓦力(van der Waals’ force)而形成,。二級結構的子單位彼此經過摺疊(folding)就形成(tertiary structure)三級結構,三級結構再彼此結合就形成四級結構 (quaternary structure)。Zinc finger屬於超二級結構(super-secondary structures),有許多不同種胺基酸的排列皆可產生zinc finger,並依照zinc finger的3D結構形狀(three-dimensional structure)分成幾種類別,如:cys2his2、gag knuckle、treble clef finger、zinc ribbon及zn2/cys6等。

首先被科學家研究透徹,且為最典型的鋅手指構形是cys2his2,具有α螺旋及β摺板各一個,大約有23胺基酸排列形成手指形狀,此構形保護著由β摺板上的2個cysteines與α-helix的2個histidines所共同鍵結的一個鋅原子。Cys2his2蛋白質在真核生物中,為常見的轉錄調控因子(transcription factor),它以α-helix嵌入DNA雙股螺旋的大溝槽(major groove)中,由β摺板與DNA上的糖-磷酸骨架(sugar-phosphate backbone)交互作用,並以鋅原子穩固著整體的架構。Zinc finger較偏好DNA上GC鹼基較多的部分,因容易形成氫鍵穩定。

Gag knuckle則與cys2his2構造相似,有比較短的β髮夾(beta-hairpin)和較大的α螺旋。人類免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus, HIV)具有gag knuckle類的zinc finger蛋白質,治療後天免疫缺乏症候群(acquired immunodeficiency syndrome, AIDS)的部分藥物即是利用鋅手指抑制劑(zinc finger inhibitors)抑制HIV gag knuckle蛋白質的合成。