微生物

受污染之土壤中微生物的重要性

受污染之土壤中微生物的重要性
國立臺灣大學環境工程學研究所研究生陳雅雯

土壤,是由岩石風化作用形成的自然體,主要由礦物質組成,經由各種風化作用與生物的活動之後,土壤的成分會與原本的岩石不同,為有機物與礦物質混合而成。土壤進入河川或湖泊之後,藉由重力而沉積在底部的物質即稱為「底泥」。

底泥又分為三大類,第一類為岩石風化後,以顆粒或黏質塊狀進入水體的砂礫或淤泥等;第二類則是水體中溶液結晶的析出而沉降於底部的物質;水中生物的殘骸或水中生物體排出的排泄物及生物產生的沉積物經由重力而沉積在底部的物質則為第三類。

河川或湖泊底泥中的微生物族群是維持水體水質、底泥生態環境重要的因素之一,不同的水質環境提供不同的碳源及營養鹽,以維持底泥中微生物的生長,形成了底泥中豐富的微生物多樣性,這些底泥具有高度多樣性的微生物所進行的碳、氮循環,鐵、錳等元素的還原以及甲烷、硫化氫的生成等生物代謝反應會進一步影響水體中的元素循環及水質狀態。因此,微生物在生物地質循環中扮演著相當重要的角色。

然而,隨著工業的蓬勃發展,一般的汙水處理程序對這些汙染物質的處理能力有一定的限制,造成大量排入河川湖泊中的水,含有一定量未被處理的汙染物質,造成河川湖泊的汙染,改變了河川水體水質的特性環境,進一步影響水中的生物型態。

微生物與有機農業(三):土壤微生物的功用

微生物與有機農業(三):土壤微生物的功用
國立臺灣師範大學生命科學系李冠群副教授、豐本生物科技公司李遠豐博士/國立臺灣師範大學生命科學系李冠群副教授責任編輯

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有益土壤微生物除了轉變有機質為肥分之外,它對促進植物生長貢獻甚巨。(圖片來源:flickr用戶nojhan)

有益土壤微生物除了轉變有機質為肥分之外,它對促進植物生長貢獻甚巨,其功用可略分如下:

分解有機物質:土壤中有機質必須經過微生物分解成可溶於水的營養分之後,才能為植物所吸收,同時微生物也必須靠這些物質分解時,取得能量與養分,才能大量繁殖以發揮其功能。此外,微生物分泌的各種有機養分及其代謝物也可供植物吸收。

微生物與有機農業(二):有益微生物與植物的健康

微生物與有機農業(二):有益微生物與植物的健康
國立臺灣師範大學生命科學系李冠群副教授、豐本生物科技公司李遠豐博士/國立臺灣師範大學生命科學系李冠群副教授責任編輯

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植物的生長與健康需要微生物為其共生伙伴,若不斷地使用農藥,則在殺除病原菌的同時也把有益微生物全部殺盡滅絕。(圖片來源:維基百科)

傳統想法中,根的功用乃是植物體定著基點,同時用之以吸收無機養分及水分的器官。這一種傳統的想法,對現今面臨「永續性地力」的困難問題,則提不出充分合理的說明來。為什麼植物所需的水分、無機肥分充分供應之後,植物仍舊不能茂盛地成長?為什麼根部不能完全地吸收這些養分?為什麼病原菌、病蟲害會孳衍繁生而不可收拾?

微生物與有機農業(一):有機農業的概念

微生物與有機農業(一):有機農業的概念
國立臺灣師範大學生命科學系李冠群副教授、豐本生物科技公司李遠豐博士/國立臺灣師範大學生命科學系李冠群副教授責任編輯

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泥土中含有各種微生物及微小生物,不管這些微生物是有益還是有害,他們之間卻維持著一種生態上的平衡,互相制衡而共存,泥土中充滿了生命體。(圖片來源:維基百科)

現今農業界常有一種錯誤的觀念,就是以為施用雞糞、豬糞或其他「生肥」如魚粉、米糠……之類的有機質就是道地的「有機農業」了,其實這些「生肥」材質並不能為植物所吸收,反而造成腐敗與病蟲害的衍生。有機質必須經過微生物分解成可溶於水的營養分之後,才能為植物所吸收,同時微生物也必須靠這些物質分解時,取得能量與養分才能大量繁殖以發揮其功能,只有當有機物與有益微生物同時並存時,才能使植物體健康成長。因此,有機農業的運作除了施用有機肥外,千萬別忘了「土壤微生物群」。

微生物與有機農業:小兵立大功的微生物

微生物與有機農業:小兵立大功的微生物
國立臺灣大學科學教育發展中心鄭文、豐本生物科技公司李遠豐博士、國立臺灣師範大學生命科學系李冠群副教授/國立臺灣師範大學生命科學系李冠群副教授責任編輯

微生物改良有機農法

若能有效地應用微生物,改良有機農法,將成為解決當前難題的創舉。(圖片來源:flickr用戶USDAgov)

科學,總是以學以致用為出發點,而世界的進步,多是為解決人類迫切的生存問題。自1990年代起,人類所面臨的隱患一觸即發,然而,世界糧食短缺的問題,經常被擺在臺灣新聞最不起眼的角落。直到2007年,當全球暖化危機四伏,乾旱水災等天然災害在世界肆虐,導致全球農糧產量大幅減少,世界各國政府才開始正視這個議題,且絕大多數的科學報導,卻總將重點放在作物改良本身。

然而,有異於以往的方法,在今年(2013)的下半年度,首度有來自科學界的最新研究,則指出有效的利用「微生物」將能增進糧產,解決世界糧食短缺的問題。這個驚人的研究報告發表在2013年八月底,旋即引起媒體廣泛的注意,原因是預計在2050年全球總人口數量將達到90億的壓力下,為了滿足其糧食需要,人類糧食必須增產70%到100%,而巧妙地運用微生物和當代科技,不僅可以達到這個目標,並且在兼顧環境和經濟的需求下,一石多鳥。

小兵立大功~生物燃料電池的原理及應用

小兵立大功~生物燃料電池的原理及應用
國立臺灣大學環境工程學研究所 楊政憲、林彥妗

前言

相較於許多傳統的環保能源,如風力發電、太陽能發電及地熱發電,生物燃料電池 (biological fuel cell) 是一種日益增長的替代能源技術。其中微生物燃料電池 (microbial fuel cell, MFC) 是一種微生物藉由三磷酸腺苷 (adenosine triphosphate, ATP)將有機或無機化合物氧化產生化學能,使電子 (electron)轉移至最終的電子受體產生電流的系統[1]。

不同於限制氧化電子受體的化學燃料電池與酵素燃料電池,微生物燃料電池有更強大的適應性[2]。到目前為止,不同的菌種如:genus GeobacterEnterobacterShewanellaBacillus經測試在微生物燃料電池中之產能具有最佳的功率。近期相關研究著重於微生物燃料電池內填充混合的微生物菌種,特別是關於它們對營養源的適應性:菌種彼此的競爭力及總體趨勢,使系統更穩定且效果更佳,且研究發現其相較於培養純菌種的系統可以得到更高密度的電流[3]。

原理

生物燃料電池之原理主要藉由微生物做為催化劑,將化學能轉化為電能。其系統組成包含陽極 (anode)、陰極 (cathode)及半滲透膜 (semi-permeable membrane)。如下圖所示,生物燃料電池之陽極灌入含有有機物之燃料供微生物反應,即提供微生物之基質 (fuel);陰極則灌入氧氣作為氧化劑;半滲透膜只容許帶正電的離子通過,即陽極中產生之質子 (proton, H+),該薄膜介於陽極槽與陰極槽間將其分隔。為避免反應機制於陽極發生,故此系統為封閉式系統,使陽極成無氧狀態,陽極不會發生反應,且陰極灌入氧氣後產生反應使質子濃度減少,誘發陽極經半滲透膜產生滲透作用。

在陽極中,基質藉由微生物行氧化反應 (oxidation),生成二氧化碳 (carbon dioxide, CO2)、電子及質子。以葡萄糖 (glucose, C6H12O6) 為例,當微生物於陽極反應時,會將葡萄糖分解產生二氧化碳、質子並釋出電子產生能量,其反應機制如下(式一):

陽極: (式一)

陰極中的氧氣則接受電子,與氫離子結合還原成水分子,如式二所示。其電子通過外部電路轉移至陰極;同時質子通過薄膜轉移至陰極。質子與電子於陰極再與氧氣行還原反應 (reduction-oxidation)產生水,反應機制如下:

陰極: (式二)

生物燃料電池產電機制

(1)   如下圖所示,於陽極加入基質供微生物反應 (Fuel in),基質於微生物氧化作用下,生成質子、電子、及代謝產物 (CO2),並將基質反應後之廢液排出 (Outlet)。

(2)   產生的電子於陽極表面經外部電路傳輸至陰極,且產生的質子經半透膜由陽極傳遞至陰極。

(3)    於陰極中,導入電子受體 (O2 in),使氧氣和遷移來之質子與陰極表面之電子發生還原反應,並將反應後所產生之產物 (H2O)排出 (Outlet)。

小眼蟲也可以立大功-微細藻生物塑膠的潛能

小眼蟲也可以立大功-微細藻生物塑膠的潛能
國立臺灣學科學教育發展中心博士陳藹然/臺北科技大學分子系暨有機高分所副教授許益瑞責任編輯

編譯來源:日本科學技術振興機構最新情報 2013年1月9日

近年來,由於全球暖化現象,造成隨之而來的危機感不斷上升,以植物性資源取代石油衍生產品的研發開始受到注意 。

每年全世界塑膠產量為2.3億噸(日本約1300萬噸),這些塑膠幾乎全部都是從石油裂解出單體,在高溫、高壓之下經由化學反應製成塑膠。此生產過程不但需要龐大的能量,還會產生大量的溫室氣體。但若以植物資源替代石油衍生產品, 預計需要幾十萬噸的植物原料,勢必造成另一種風險,因此供應量與價格必須慎重考量。此外,若是利用微生物或生物催化劑的生產技術開發,其生產過程所消耗的能源,會是1大問題。有鑑於此,採用不具糧食競爭性的非食用植物的作為材料,例如藻類塑膠的生產,會是比較恰當的選擇。

日本產業技術綜合研究所生物醫學部門、宮崎大學農學部和日本電器株式會社(NEC)合作,共同研究開發出以眼蟲抽取物為主成份的微細藻生物塑膠。微細藻生物塑膠具有不遜於一般生物塑膠和石油樹脂的熱塑性和耐熱性。

科學十年回望(2)

科學十年回望(2)
知識通訊評論第100期

 

微型時間機器再訪古代生物

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在過去十年裡,功能強大的新興X射線掃描和三維電腦模型已經改變了人們對骨骼、牙齒和貝殼的分析。然而,更具革命性的事情已在進行中:這是一種新型分析,能揭示骨骼證據無法提供的生物體解剖適應性,如恐龍羽毛的顏色或長毛猛獁象如何耐寒。

在過去十年裡,功能強大的新興X射線掃描和三維電腦模型已經改變了人們對骨骼、牙齒和貝殼的分析。然而,更具革命性的事情已在進行中:這是一種新型分析,能揭示骨骼證據無法提供的生物體解剖適應性,如恐龍羽毛的顏色或長毛猛獁象如何耐寒。

微生物與疾病(Microorganisms and Disease)

微生物與疾病(Microorganisms and Disease)
國立台灣師範大學生命科學研究所林汝黛碩士生/國立台灣師範大學生命科學系張永達副教授責任編輯

即使在微生物被發現後,人們仍不認為微生物與傳染疾病具有關連性。即使Edward Jenner能以接種牛痘來預防天花,但也無法解釋成功預防天花的原因。直至十九世紀的Casimir Davaine首度證明特殊微生物能引發特殊疾病。十九世紀末的Robert Koch已能將致病細菌分離,感染寄主後造成特定的感染症狀,證明了單一種細菌會引起單一種疾病。

在微生物與疾病的關係被建立後,微生物感染造成可傳染性疾病的這種概念,普遍的流傳。科學家在對煙草葉鑲嵌病的觀察與實驗後,認為引起這種疾病的原因也是細菌。但是因為它可以通過可濾出細菌的陶瓷濾網,當時的科學家推論病毒是一種與細菌類似的病原體,所不同的僅在於病毒必須在生活的細胞內才能繁殖,而且體積十分微小,能夠通過細菌濾器,也無法在光學顯微鏡下觀察。所以Martinus Willem Beijerinck在1898年另為這個史無前例的「小細菌」取名為Virus。

電子顯微鏡問世後,人類得以肉眼觀察病毒的形態。1939年,G.A.Kansche在電鏡下直接觀察到了菸草鑲嵌病毒(TMV)與番茄黃化花葉病毒(TYMV)的顆粒,並以奈米為單位指出了病毒的大小。1953年,科學家們注意到病毒的增殖必定需要有活體細胞的存在。