微生物

轉形作用

轉形作用(Transformation)
國立臺灣師範大學生命科學系研究助理林如愔

轉形作用(也稱轉化作用)是從細胞膜直接將異源DNA分子納入細胞內,使受體細胞獲得新的遺傳性狀的方法之一,以細菌而言,另外兩個常見的方法分別是接合作用(conjugation)與轉導作用(transduction),為微生物遺傳學、分子遺傳學、基因工程等研究領域的基本實驗技術。

接合作用

接合作用 (Conjugation)
國立臺灣師範大學生命科學系研究助理林如愔

細菌的接合作用是細菌間傳遞遺傳物質的方法之一,它必須由兩細菌建立實體的連結,像是運輸孔道的功能,再把DNA由一方傳送到對方菌體內。接合作用最早於1946年由列德伯格(Joshua Lederberg)和塔圖姆(Edward Tatum)發現。進行接合的兩細菌,除了必須有直接接觸之外,還須具備另一特性:兩者是不同的交配型(mating type),供體細胞(donor cell)必須攜有質體,而受體細胞(recipient)通常則否。在革蘭氏陰性菌中,質體DNA帶有合成性線毛(sex pili)的基因,性線毛突出於供體細胞表面,當它與受體細胞靠近時,能拉近兩細胞的距離以便直接接觸;革蘭氏陽性菌則是靠細胞表面分泌的黏性物質,讓細胞直接接觸。

大腸桿菌E.coli的F因子(fertility factor, F-factor, F-plasmid),即F質體,是最先被發現可於細菌接合作用時被轉移的質體(plasmid)。F質體既可以獨立存在於細胞質中,也可以嵌入細菌的染色體,長度約10萬個鹼基對,擁有自己的複製起點。擁有F質體的供體細胞(donor)簡稱為F+,反之,受體細胞(recipient)稱為F。如圖一所示,接合作用發生前,F+細胞會利用性線毛(pilus)”辨別”F細胞,性線毛前端的蛋白可以將自己固定在F細胞的表面,並且拉近F+與F細胞的距離(步驟1~2)。性線毛基部的酵素,能啟動細胞膜的融合,因此F質體的傳輸並非靠性線毛做傳遞,性線毛只是幫助F+與F細胞拉近距離並開始接合作用。接下來就是F質體如何由F+細胞傳給F細胞(步驟3),F質體是環形的雙股DNA,在傳輸之前,其中一股會被切出一個切口,由切口為傳輸的起點,只將這單股(T-strand)傳至F細胞,留在F+細胞的另一個環形單股DNA,會被視為複製模板再合成完整的F質體,而原本的F細胞在接受T-strand之後,隨即也會合成其互補股,轉變成擁有F質體的新的F+細胞(步驟4)。

圖一、大腸桿菌(E.coli) F-受體細胞的轉形過程

受體細胞因接合作用能獲得原來沒有的能力,例如:對抗生素的抗藥性;或是新的新陳代謝功能,讓其能使用不同的營養來源或代謝物。整體而言,對多數的有害細菌來說,接合作用更有益其族群的擴張。

流行性感冒病毒的抗原漂變與抗原移型

流行性感冒病毒的抗原漂變 (Antigenic drift)與抗原移型 (Antigenic shift)
國立臺灣師範大學生命科學系研究助理陶韻婷

流行性感冒病毒的遺傳物質為8條單股 (single strand) RNA,簡寫為ss-RNA,ss-RNA與核蛋白 (nucleoprotein, NP)相結合,纏繞成核糖核蛋白體 (ribonucleoprotein, RNP),先後由核殼蛋白層 (nucleocapsid)及基質蛋白質 (matrix protein)包覆其外,再外圍則有雙層脂膜 (lipid bilayer)圍繞,雙層脂膜又稱外套膜 (envelop),上面有兩種重要的醣蛋白,分別為血凝素蛋白 (hemagglutinin, HA)與神經胺酸酶 (neuraminidase, NA)。血凝素蛋白能與宿主細胞膜上具有唾液酸(sialic acid,又稱 N-乙醯神經胺酸 (N-acetylneuraminic acid)的醣蛋白或醣脂結合,開啟病毒進入宿主細胞的第一步。當產生的新病毒要離開宿主細胞時,神經胺酸酶會切斷新病毒與唾液酸醣蛋白的結合而釋出,再去感染其他的宿主細胞。克流感藥物能阻斷神經胺酸酶的作用,讓新合成的病毒無法釋出去感染其他正常細胞。

禽流感病毒 (H5N1) 能不能由空氣傳染哺乳動物?一個現代潘朵拉盒子的爭議!

禽流感病毒 (H5N1) 能不能由空氣傳染哺乳動物?一個現代潘朵拉盒子的爭議!
長庚大學生物醫學系周成功教授

禽流感病毒 (H5N1) 平時只在家禽鳥類間散佈,不會造成宿主死亡。1996年第一個會感染人的變種病毒出現在廣東。現在知道這個病毒至少發生了三次基因突變,使得它能在人體內繁殖! 兩個突變發生在病毒表面與宿主細胞結合的蛋白,讓病毒可以和人類細胞結合。另一個突變則發生在負責病毒RNA複製的酵素。正常H5N1病毒感染體溫較高的腸胃道細胞,但是這個突變使得酵素在體溫較低的上呼吸道細胞仍然得以複製病毒RNA。

WHO迄今記錄606人曾感染H5N1,而死亡人數高達357人[1]。雖然H5N1感染人類的致死率如此高,但H5N1仍然只能透過親密接觸才會感染人。為什麼H5N1不能透過空氣飛沬傳染人?H5N1真的完全沒辦法透過空氣飛沬傳染人嗎?如果讓它在人體內不斷繁殖,它會不會演化出新的變種,而可以透過空氣飛沬傳染?

荷蘭的病毒學家Fouchier為了要回答這個問題,設計了一個非常簡單的實驗。他首先準備了一株帶了3個特定基因突變,能感染哺乳動物的H5N1。再將這個病毒接種感染一隻雪貂,然後連續不斷地透過接種傳染到下一隻。每次接種感染後,就分離出新產生的病毒,接著測試這些病毒會不會透過空氣飛沬傳染給隔壁籠子裡的雪貂?實驗的結果很清楚:經過10次接種傳染後,H5N1真的可以藉由空氣飛沬傳染別隻的雪貂!

抗藥性的演化(The Evolution of Drug Resistence)

抗藥性的演化(The Evolution of Drug Resistence)
國立師大附中生物科楊瀅涓老師/國立臺灣大學動物學研究所陳俊宏教授責任編輯

金黃色葡萄球菌在抗生素培養基上之測試。(圖片來源:http://en.wikipedia.org/wiki/Antibacterial)

這幾年來,抗藥性(drug resistance)已經從醫學術語,轉變為人人熟知的新聞名詞,這也突顯了問題的嚴重性。但這不僅在醫學上是重要問題,也是演化證據之一。例如在 1940年代使用盤尼西林治療金黃葡萄球菌時,抗生素一開始確實是大幅提高了人類感染疾病的治癒率,然而基於天擇,細菌也會衍生出各種嘗試存活的方式,再 逐步演化出具有抗藥性的細菌,並在有抗生素存在的環境下,持續大量繁殖。

溶瘤病毒(Oncolytic Virus)與癌症的治療

溶瘤病毒(Oncolytic Virus)與癌症的治療
台北市立成功高級中學生物科張春梅老師/國立台灣大學動物學研究所陳俊宏教授責任編輯

溶瘤病毒(Oncolytic Virus)是一種能偏好感染並溶蝕腫瘤細胞的病毒。溶瘤病毒只針對腫瘤細胞而不影響正常組織的特性顯然可應用於癌症的治療,目前已經發展了幾種類型的溶瘤病毒療法(oncolytic virotherapeutics),包括直接以溶瘤病毒破壞癌細胞,或者修飾病毒做為專一性載體,將表現抗癌蛋白的基因攜入癌細胞中。

目前已經發展下列幾種類型的溶瘤病毒:

酵母菌什麼時候才會進行酒精醱酵?

酵母菌 (yeast) 什麼時候才會進行酒精發酵 (alcohol fermentation)?
長庚大學生命醫學系周成功教授/長庚大學生命醫學系周成功教授責任編輯

太陽是現今生物世界中能量的源頭,那些能行光合作用的生物,可以將太陽的光能轉變成生物能,將二氧化碳轉化成醣類分子。不能行光合作用的生物就只有直接抑賴那些行光合作用的生物作為能量(食物)的來源。當生物吃下食物後,儲存在食物分子中的能量,也必須經過分解代謝的過程,才能轉換成生物世界中能夠使用的能量。

地球上所有的生命形式,從細菌到人,都使用完全一樣的能量貨幣:ATP!ATP在體內水解時會放出能量。這個能量的額度固定,大小適中,剛好可以應付生命中進行各種不同化學反應所需要的能量(圖一)。除了ATP之外,食物分子分解代謝往往還會產生另一種能量貨幣:儲存在NADH分子中的高能量電子(圖二)。要說明生物如何從事能量轉換最好的例子就是葡萄糖分解,因為從細菌到人都是利用完全相同的一套反應來進行。

圖一:ATP的結構與水解的過程

人體消化道微生物相(Microbiota)對健康的影響

人體消化道微生物相(Microbiota)對健康的影響
台北市立成功高級中學生物科張春梅老師/國立台灣師範大學生命科學系李冠群助理教授責任編輯

2010年英國的《每日電訊報》曾報導美國麻州綜合醫院有一位 2 歲小女孩,因原因不明的腹瀉而威脅到生命,兒科醫生試盡各種方法,連萬古黴素(vancomycin)和仍在實驗階段的抗生素都用上了,卻依然無效,最後決定採取另類的方法,不再針對引起疾病的可能細菌,而是將來自健康腸道的稀釋糞便水溶液送入女孩的腸道中,醫生期待藉健康腸道中正常共生細菌的介入而逐漸抑制病菌的增殖與生長。幾週後,小女孩康復了。科學家因此懷疑,常規治療對某些腸道感染者失效,可能是因為患者體內缺乏具有保護腸道功能的某些腸內菌。

乳酸發酵(Lactic Fermentation)-下

乳酸發酵(Lactic Fermentation)-下
台北縣私立南山中學生物科楊瀅涓老師/國立台灣師範大學生命科學系李冠群助理教授責任編輯

乳酸與運動

在持續的強烈運動過程中,人體需要大量能量。當組織無法獲得足夠的氧、或無法快速處理氧氣的情況下,丙酮酸脫氫酶(Pyruvate dehydrogenase complex)便無法及時將丙酮酸(pyruvate)轉換為乙醯輔酶A(Acetyl-CoA)進入有氧呼吸,組織也因此無法藉有氧呼吸獲得充足能量、丙酮酸開始堆積。

乳酸發酵(Lactic Fermentation)-上

乳酸發酵(Lactic Fermentation)-上
台北縣私立南山中學生物科楊瀅涓老師/國立台灣師範大學生命科學系李冠群助理教授責任編輯

定義

乳酸發酵一般是指微生物由碳水化合物生產乳酸的過程。依生成產物可以將乳酸發酵分為:
1.同型乳酸發酵(Homolactic fermentation):發酵結果只產生乳酸
2.異型乳酸發酵(Heterolactic fermentation):除生成乳酸外,還生成CO2和乙酸。

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